开始游戏
游戏刚开始会让玩家选择语言，为了方便我先选择了英语
开场动画可以开3D进行欣赏
接着很用心的一段介绍后决定角色性别以及取名字
主角在卡车上，下车后发现到了未白镇（ミシロタウン Littleroot Town），妈妈出来让主角进家里看看，上楼调时钟！（其实是系统自动调的噗）下楼后妈妈在看电视，并叫主角赶过去看爸爸，可惜主角过去的时候节目结束了，妈妈便让主角去找住在未白镇的小田卷博士
出门后隔壁是CP（误）的家，进去后丈母娘大人（喂）很热情地打了招呼，然后上楼后看到CP（女主名为 May）正在穿衣服不对，正在整理东西，一阵寒暄后CP走了
那么离开CP家去找可怜的小田卷博士吧~
小田卷博士在被土狼犬追杀，上前去他就请求主角帮忙，从他的包里选择一只PM
分别是木守宫，火稚鸡，水跃鱼，选择后就和土狼犬发生对战！（我选择了木守宫）
| 土狼犬 lv3 |
胜利后博士带主角回到研究所，并把PM赠送给主角，并让主角前往103号道路找CP玩（
开始旅途吧！
通过101号道路来到了第二个城镇——古辰镇（コトキタウン Oldale Town）
一进城商店的员工便上前赠送了一个
左边PM中心可以回复体力
再往上就来到了103号道路
通过几个草丛，看到CP后和她对话，开始战斗！
| 克制主角的御三家一段 lv5 |
胜利后CP说回研究所，也跟着一起回去吧！
回到研究所博士给了主角精灵图鉴，CP给了10个
临行前妈妈出来煽情地告别
进入101号道路时CP追上来升级了主角的口袋妖怪领航员Plus，追加了图鉴功能
并教导了主角如何蹑手蹑脚捕捉出现在草丛中的尾巴（轻轻推动滑轮即可），草丛中的土狼犬可能是带有遗传技能的（我抓到的是遗传了雷牙的土狼犬）那么整装待发，旅途正式开始！
从古辰镇左边通过102号道路往下一个城市出发吧
路上碰到几个训练家，一一打败吧
在到达城镇前遇到了CP，一起看了狩猎凤蝶群飞过
接着到达了第三个城市——橙华市（トウカシティ Petalburg City）
这是主角爸爸的道馆所在的城镇
那么赶快去道馆里找爸爸“挑战”吧！
进入道馆发现爸爸正在道馆门口，和一个少年挑战道馆失败的少年说话，上前寒暄后爸爸把主角带进道馆，这时候进来了一个绿色头发的少年
他就是住在附近的小光（Wally）
爸爸将蛇纹熊借给小光，让主角带着小光去草丛并教他捕获PM
小光的运气真是太赞了哇第一次进草丛就碰到了♂的
成功收服后他向爸爸道谢后给主角升级了口袋妖怪领航员Plus，追加了PSS，Amie和超级训练功能后就离开了
爸爸让主角先去附近的卡那兹市的道馆挑战
那么，向着下个城市出发吧！
在104号道路虐虐几个训练师
接着就来到了橙华森林
顺着森林向前走，看到一个正在寻找蘑蘑菇的人，他是德文制造股份有限公司的职员
突然就冲出了一个着装怪异的人，要抢走职员的公文包，职员寻求主角帮助，无奈只好帮了
| 火岩队/水舰队成员 | |
| 土狼犬 lv9 | |
胜利后他撂下狠话逃走了，职员表示感谢送了主角一个
继续向前走就可以走出森林了！走出森林时画面转到一个躲在森林里的火岩队/水舰队成员（Zinnia），说了一些话
离开森林后，左边的花店 圣籘华门前的小孩会赠送
花店里每天可以随机获得
通过水上浮桥后就到达了第四个城市——卡那兹市（カナズミシティ Rustboro City）
这个城市也是第一个道馆（岩石）所在地
进城时CP从商店出来提示有道馆
精灵中心左边的屋子里有个大叔会赠送给主角
精灵中心右上方的 训练家培育学园 里的老师会赠送主角
精灵中心后面的公寓二楼有个训练师会赠送
道馆右边的屋子里有人会愿意用
整理整理就可以去挑战道馆了！
打过三个带着
开始首次道馆战吧！
|
杜娟 ツツジ Roxanne |
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| 小拳石 LV12 | 技能：撞击+变圆+岩石封闭 | |
| 朝北鼻 LV14 | 技能：撞击+变硬+岩石封闭 | |
胜利后获得岩石徽章以及
走出道馆后，看到德文公司的职员在追赶一个 火岩队/水舰队 的成员，跟上去发现职员站在那里，和他对话他便寻求主角的帮助，夺回被抢走的公文包，那么向右走上116号道路吧！
和许多训练师战斗后到达了卡绿隧道的洞口，看到一个老人（哈奇）在洞口很着急，上前对话，他说自己的
进入山洞后看到 水舰队/火岩队 的成员，就是他抢走了公文包和小皮，上前对战
| 火岩队/水舰队成员 | |
| 土狼犬 lv12 | |
胜利后他将公文包和小皮归还后逃走了，老人进山洞向主角表达了感谢并说他就在104号道路的海边小屋里如果有任何需要帮助的地方就可以去找他，然后领走了小皮
回到卡那兹市将公文包归还给职员，职员表达感谢赠送主角一个
社长将主角的领航员升级，增加了电视导航功能，并委托主角将
离开公司时遇到了CP，告诉主角哈奇老人的住所，然后就原路返回去找哈奇老人吧！
（楼主尾巴捕获了一只遗传了重臂锤的
来到哈奇老人的家，和原版一样哈奇老人在和
上前对话就可以选择前往武斗镇（ムロタウン Dewford Town）了
码头下第一个屋子里有人会赠送
道馆右边的钓鱼大叔会赠送
先去挑战道馆吧！
武斗道馆的机关和原版有一些不一样，变成了踩按钮时开灯看清楚地图，离开按钮就全黑……
记住地图的话还是不困难的
打过几个小兵后就到了藤树面前了
|
藤树 トウキ Brawly |
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| 腕力LV14 | 技能：瞪眼+手刀+地球投+巨大化 | |
| 幕下力士LV16 | 技能：猛推+打落+飞沙脚+巨大化 | |
胜利后获得拳击徽章 以及
接着给大吾送信吧
进入石之洞窟后走一段路就会碰到一个登山男，他赠送玩家
往前进入一个洞，看到大吾正在观察一幅巨大的古代壁画
上前对话后将
*注意石之洞窟目前还是不能往更深处去的（需要马赫自行车）
继续乘坐船到达了109号道路
和训练师对对战后就到达下一个城市——凯那市（カイナシティ Slateport City）
PC左下方的屋子里有个女NPC会赠送
PC左上方的华丽大赛会场内有个海员会赠送
*海边市场左下角可以捡到胡地Mega石
先去博物馆下方的造船厂去找职员吧，职员告诉玩家船长在博物馆里
进入博物馆上二楼就看到船长，将包裹送出，这时候 火岩队/水舰队 成员出现了，战斗吧
（连续单打）
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火岩队成员1号 |
火岩队成员2号 | ||
| 呆火驼 LV16 | 超音蝠 LV14 | ||
| 呆火驼 LV14 | |||
（连续单打）
| 水舰队成员1号 | 水舰队成员2号 | ||
| 利牙鱼 LV16 | 超音蝠 LV14 | ||
| 利牙鱼 LV14 | |||
都战胜后火岩队/水舰队首领出现了，说了一堆自己的理想并警告了主角后离开，下楼发现还有个火岩队/水舰队成员没走，上前对话后他送了
向上想要前往下一个城市的时候，碰到了Lisia带着
继续向紫堇市进发吧！
在110号道路上遇到火岩队/水舰队队员，说要向烟突山进发，并在紫堇市休息
路上的机关屋可以去挑战一下噗（机关大师会赠送 穿洞绳）
在自行车道下遇到CP，触发对战！
| CP | |
| 蘑蘑菇/熔岩虫/吼吼鲸 除去克制主角属性的另外两只 Lv18 |
|
| 克制主角的御三家二段 Lv20 | |
战胜后CP帮忙恢复了体力，并赠送了
继续向前走不久就到下一个城市——紫堇市（キンセツシティ Mauville City）了！
进城是看见小光要说去挑战道馆后径直向道馆走去
紫堇市设施好多，PC右边有个大叔会赠送Speed power，先向右去拿个自行车回自行车道练练级吧（噗
*进入自行车道后不急着上去，下面有条小路，走进去可以拿到 雷电兽Mega石（凌晨3点也能拿到我去……）
整理整理就可以去打道馆啦（紫堇市有点类似XY中的中心城市，所以可能可以花些时间在各种设施的探索上，因为要速攻所以就先不去玩了哈）
来到道馆前看到小光和他舅舅，舅舅在劝说小光不要勉强自己去挑战道馆，然后求助主角对战，希望能够证明自己。
| 小光 | ||
| 拉鲁拉斯 LV17 | ||
胜利后小光失落的离开了，舅舅为了表达谢意赠送了
接着就去挑战道馆吧！
紫堇道馆的机关和原来类似
打过几个小兵后就可以打铁旋了！
|
铁旋 テッセン Wattson |
||
| 小磁怪LV19 | 技能：电磁波+撞击+闪电交替 | |
| 雷电球LV19 | 技能：滚动+充电+闪电交替 | |
| 三合一磁怪LV21 | 技能：超音波+磁体炸弹+闪电交替 | |
胜利后获得 电力徽章 以及
向左就到117号道路，这里有饲养屋
*花圃下面的小路里能够拿到 大嘴蛙Mega石
打过一堆训练师后就到了新城镇——绿荫镇（シダケタウン Verdanturf Town）
华丽大赛会场里有个女孩会赠送
左下角的一间屋子里有NPC会检测亲密度
进入卡绿隧道，隧道里有一对情侣被石头挡住无法相会，用碎岩帮助他们后，*男方表示感谢赠送了 波士可多拉Mega石
回到紫堇市，向上往烟突山前进，在出口处看到火岩队/水舰队队员，说了目的地是烟突山后就走了
从紫堇市向上就是111号道路和112号道路
在112号道路上遇到了CP，CP向主角指示了烟突山的位置，给主角恢复了体力，并赠送了
通往烟突山的缆车入口被火岩队/水舰队成员挡住，只好从另一边的热焰小径去下个城镇
通过热焰小径后在经过111号道路，路上会遇到秘密基地大师，赠送给主角
继续向前在113号道路遇到了CP，CP帮主角回复了体力并说要找秋叶镇的博士调查陨石对PM的影响后走了
113号道路可以捡到
接着就到了新城镇——秋叶镇（ハジツゲタウン Fallarbor Town）
PC里电脑前站着储存系统的开发员真由美，对话后她离开了
城镇最左边的屋子里可以用
在城镇里遇到了CP，将主角带进博士的家说博士被火岩队带到流星瀑布去了，然后请求主角一起去营救
那就继续向前吧
进入114号道路
上方小屋里有个小孩会赠送
屋外有个绅士会赠送
向下走就能看到真由美的屋子，进去打招呼，她赠送了橡实果玩偶
继续向下看到CP正在追赶火岩队队员
追上去进入流星瀑布
向前看到了CP在和火岩队干事火村对峙，上前和CP一起战斗
（双打）
| 火岩队干事 火村 | 火岩队队员 | |||
| 大狼犬 lv23 | 瓦斯弹 lv23 | |||
| 呆火驼 lv23 | ||||
| 水舰队干事 泉美 | 水舰队队员 | |||
| 大狼犬 lv23 | 臭泥 lv23 | |||
| 利牙鱼 lv23 | ||||
胜利后水舰队（火岩队）首领水梧桐（赤焰松）出现了，火岩队（水舰队）队员抢走了
水梧桐（赤焰松）上前和主角对话了几句后就离开前往烟突山了
主角和CP把博士带回家，博士赠送了
然后CP问是否要和她一起回紫堇市（我手贱点了是呜呜呜）
然后就向着烟突山前进吧
岩浆包围的战斗！火岩队（水舰队）首领赤焰松（水梧桐）！
继续经过111号道路和112号道路来到缆车站，原来挡住入口的火岩队（水舰队）队员离开了
乘坐缆车到烟突山吧！
到达后看到水舰队和火岩队在激战
加入战斗吧！
打过一个小兵后再度和火村（泉美）相遇，火村（泉美）表示了对主角的怨恨后触发战斗
| 火岩队干事 火村 | ||
| 瓦斯弹 lv24 | ||
| 呆火驼 lv24 | ||
| 水舰队干事 泉美 | ||
| 臭泥 lv24 | ||
| 利牙鱼 lv24 | ||
战胜后火村（泉美）让开让主角去找首领赤焰松（水梧桐）
赤焰松（水梧桐）在研究陨石，和主角说到了陨石和Key石，Mega石的关系（跳太快没看特别清楚），接着触发战斗
| 火岩队首领 赤焰松 | ||
| 大狼犬 lv25 | ||
| 大嘴蝠 lv25 | ||
| 喷火驼 lv27 | ||
| 水舰队首领 水梧桐 | ||
| 大狼犬 lv25 | ||
| 大嘴蝠 lv25 | ||
| 巨牙鲨 lv27 | ||
被战胜后的赤焰松吓得惊魂失色（表情太生动了哈哈哈）
赤焰松（水梧桐）把
水梧桐（赤焰松）上前说了几句话后也离开了
从对战的地方往左阶梯下行可以拿到
从烟突山向下经过凹凸山道
这里可以获得
继续向下就到达了新城镇——釜炎镇（フエンタウン Lavaridge Town）
PC里可以泡温泉，但是不管走男的还是走女的都是没其他人的（噗
沙滩上的老奶奶会赠送主角一颗
那么挑战道馆吧！
釜炎道馆的机关和原先类似，相对更简单，洞变成了木板，环境变为和温泉相关，忍者变为藏在温泉中
通过机关后来到亚莎面前，挑战吧（亚莎也是蠢萌蠢萌的哈哈哈）
|
亚莎 アスナ Flannery |
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| 熔岩虫LV26 | 技能：燃烧殆尽+落石+光之壁+放晴 | |
| 呆火驼LV26 | 技能：大地之力+喷烟+超级健忘+放晴 | |
| 煤炭龟LV28 | 技能：燃烧殆尽+压制+诅咒+放晴 | |
战胜后获得 烈焰徽章 以及
走出道馆时遇到了CP，赠送了
这时CP问要不要一起回橙华市，为节省时间我再次选择了"是"
橙华道馆的机关和原来几乎一模一样
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老爸 |
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强力房间（ |
一击必杀房间（ |
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能力不减房间（ |
防御房间（ |
回复房间（ |
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|
速度房间（ |
命中房间（ |
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入口 |
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来到老爸的房间，老爸正在静坐修行，上前对话开始战斗吧（千里真男神！！帅哭了）
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千里 センリ Norman |
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| 请假王LV28 | 技能：鼓掌+报仇+哈欠+暗算 | |
| 过动猿 LV28 | 技能：疯狂乱抓+暗算+报仇+鼓掌 | |
| 请假王 LV30 | 技能：循序渐进+虚张声势+报仇+鼓掌 | |
胜利后获得 天秤徽章 以及
爸爸把主角带出道馆后看到小光和他爸爸，小光的爸爸赠送了
小光将主角带走后，两个爸爸都很欣慰也有些失落
小光直接将主角带到紫堇市
在118号道路冲浪后有个钓鱼大叔会赠送
再往里走时遇到了大吾，寒暄了几句大吾准备离开时，拉帝亚斯（拉帝欧斯）飞了过来
大吾说拉帝亚斯（拉帝欧斯）是在寻求帮助，便带着主角坐了上去，飞到了南方小岛
大吾说这个小岛上居住的两只精灵（水都兄妹）和Mega进化有所关系，这可能成为危险的因素
往南方小岛更深处去，见到了拉迪奥斯（拉帝亚斯），这时候火岩队干事篝火（水舰队干事海潮）带着一个小兵出现了，大吾说因为水都兄妹意识到他们的到来所以才寻求帮助
篝火（海潮）要夺走拉迪奥斯（拉帝亚斯）身上的Mega石，主角和大吾不同意，触发战斗
| 火岩队干事 篝火 | 火岩队成员 | ||
| 喷火驼 lv31 | 瓦斯弹 lv29 | ||
| 水舰队干事 海潮 | 水舰队成员 | ||
| 巨牙鲨 lv31 | 臭泥 lv29 | ||
胜利后他们离开了
接着拉帝欧斯（拉帝亚斯）选择加入主角队伍，不触发对战直接加入队伍………………（拉帝欧斯/拉帝亚斯身上携带着拉帝欧斯Mega石/拉帝亚斯Mega石）*所以如果要刷个体和性格的话，需要在和火岩队（水舰队）战斗前保存
| 拉帝欧斯 lv30 | 治愈波动+龙之吐息+光栅净化+精神转移 | |
| 拉帝亚斯 lv30 | 治愈波动+龙之吐息+迷雾球+精神转移 |
接着大吾赠送了Mega手环，向主角介绍了Mega进化
拉迪亚斯将主角和大吾送回118号道路，然后大吾告别离开
118号道路上的高草丛有几率触发群战（自行车终于可以进高草丛了！）
向右123号道路上有个小女孩会赠送TM99 闪耀光芒
向上就是119号道路，高草丛上方屋子里可以回复体力
再往上走就到了天气研究所，目前被火岩队（水舰队）占领
左上角的床可以回复体力，接下来就是打败火岩队（水舰队）了！
打败小兵后上二楼，看到火岩队干事火村（水舰队干事泉美）抢走了研究员的文件，打败几个小兵上前阻止，触发战斗
| 火岩队干事 篝火 | |
| 喷火驼 lv32 | |
| 水舰队干事 海潮 | |
| 巨牙鲨 lv32 | |
胜利后火村（泉美）警告了主角后离开，临走时说首领去了送神火山
研究员们赠送了 天气小子，并告诉主角古代转换形态后的固拉多（盖欧卡）给世界造成了巨大的灾难，他们称之为 原始进化，只有两只超古代PM才可以原始进化
继续向下个城市前进
通过吊桥后遇到了CP，触发战斗
cp
战胜后CP赠送了
再往前走就到了新的城市——茵郁市（ヒワマキシティ Fortree City）
上方第二个木屋里左边的老人如果答对问题就可以获得
通往道馆的路被看不见的东西堵住了，只好再往前走，看到大吾，说了一句“那只PM应该会在120号道路找到”就走了，跟上去
120号道路的水面，天旱焦岩里可以捡到
在吊桥上找到大吾后，大吾给了主角
然后大吾看到主角背包里发出了一道光，自言自语说“是一块陨石吗”，然后告别离开了（查看背包发现陨石发生变化了）
去挑战道馆吧
原本挡路的变隐龙被发现后逃走了，道馆后面可以捡到
茵郁道馆的机关和原来没有什么差别，甚至更简单，打过小兵后就来到娜琪的面前，触发战斗
|
娜琪 ナギ Winona |
||
| 大王燕 LV33 | 技能：电光一闪+燕反+影分身+莽撞 | |
| 大嘴鸥 LV33 | 技能：水之波动+羽栖+保护+燕反 | |
| 盔甲鸟 LV33 | 技能：飞沙脚+真空斩+钢翼+燕反 | |
| 七夕青鸟 LV35 | ||
天气小子lv35祈雨+放晴+冰雹+气象球
从茵郁市通过120号道路（途中可以捡到
追上去，平台上有个乔伊小姐可以回复体力
进入送神火山内部，和原作不同的是，要到达3层才可以到送神火山外部
内部最顶层能够捡到
送神火山外部可以捡到
在送神火山外部战胜一群火岩队（水舰队）队员后，看到赤焰松（水梧桐）在观察两颗宝珠后走向了红色宝珠（蓝色宝珠），然后注意到了主角
他告知主角没时间陪主角玩，下一站是凯那市后就离开了，留下了篝火（海潮） 和主角触发战斗
| 火岩队干事 篝火 | |
| 喷火驼 lv38 | |
| 水舰队干事 海潮 | |
| 巨牙鲨 lv38 | |
战胜后篝火离开了
两个守护宝玉的老人说大事不好，然后让主角将蓝色宝珠（红色宝珠）带走，请求主角追上赤焰松（水梧桐）并将红色宝珠（蓝色宝珠）夺回
飞到凯那市，看到PC右上方的码头门口，船长刚接受完采访，和主角寒暄几句后突然听到有人广播说“潜水艇他收下了”
进入码头发现赤焰松（水梧桐）和火村（泉美）夺走了潜水艇，他们留下了两个火岩队队员后离开，触发战斗
（连续单打）
| 火岩队队员 男 | 火岩队队员 女 | ||
| 大狼犬 lv36 | 呆火驼 lv34 | ||
| 大嘴蝠 lv34 | |||
（连续单打）
| 水舰队队员 男 | 水舰队队员 女 | ||
| 大狼犬 lv36 | 利牙鱼 lv34 | ||
| 大嘴蝠 lv34 | |||
战胜后他们离开了，船长请求主角帮忙夺回潜水艇，答应后船长便带着主角来到水静市的码头
水静市和CP的告别！探寻火岩队（水舰队）的秘密基地！
在水静市遇到了CP，她介绍了百货大楼，然后触发对战
| CP | |
|
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大王燕 lv37 |
| 斗笠菇/熔岩蜗牛/吼鲸王 除去克制主角属性的另外两只 lv37 |
|
| 克制主角的御三家三段 lv39 | |
胜利后CP说她打算回未白镇了，图鉴收集的差不多所以想给博士看看，然后主角背包里的陨石又发出光芒并发生变化了，就此告别
水静市海边的屋子里可以获得
接着来到水静市右上方的火岩队（水舰队）基地
机关没有什么难度，基地内有床可以回复体力，还可以捡到
打过前期的小兵后来到潜水艇所在地，此时被5个小兵挡住，展开5打1
| 火岩队/水舰队队员*5 | |
| 土狼犬*5 lv18 | |
胜利后他们离开让出了路
接近潜水艇看到篝火，触发战斗
|
火岩队干事 篝火 |
|
| 喷火驼 lv39 | |
| 水舰队干事 海潮 | |
| 巨牙鲨 lv39 | |
胜利后发现潜水艇趁机离开了，篝火（海潮）告诉主角想追潜水艇的话就去找海底洞窟吧
走出基地发现原本挡路的吼吼鲸不见了，可以准备出海了！
进入124号水道，开始正式的海上征程！
路上的屋子里可以用碎片换 进化石（屋子外的女生说如果用巨牙鲨冲浪可能会有不同的体验）
红色碎片→火之石
蓝色碎片→水之石
黄色碎片→雷之石
绿色碎片→叶之石
经过一小段海路就到达下一个城市——绿岭市（トクサネシティ Mossdeep City）
马上去挑战道馆吧！
道馆的机关和原先类似，但是效果做的比以前更有超能系的感觉，相比难度变小
打过几个训练师后就来到枫和楠的面前
| 枫与南 フウとラン Tate and Liza （双打） | ||
| 月石 LV45 | 技能：光之壁+精神干扰+催眠术+冥想 | |
| 太阳岩 LV45 | 技能：放晴+岩崩+精神干扰+阳光烈焰 | |
战胜后获得 心灵徽章 以及
走出道馆后突然发生了地震以及震耳的爆炸声，然后看到海上向天空射出了一道笔直的绿色光线
围观的人们说是128号水道的方向，引起一阵恐慌
然后画面转到了射出光线的地方（用于提示主角）
大吾找到主角说有话要谈，带主角去他自己的家里
大吾的话：（大致翻译）
让我们先理解一下我们的世界现在正在发生什么
刚才的地震和爆炸声说明深海底下很久远的封印现在被解除了
从古代被封印在128号水道深海的超古代PM 一直在海底洞窟沉睡
海底洞窟的入口被某只PM的力量所封印，以防任何人类或者PM闯入
但现在看来 诡计多端且可怕的火岩队（水舰队）解除了封印
毫无疑问他们企图复活超古代PM
一旦他们成功，看起来他们是想要自私地利用其力量
主角，如果火岩队（水舰队）得到了超古代PM的力量，世界自然的平衡就会被破坏
一个前所未有的危机将会降临到这个星球上的所有生物
我决定尽我所能平息这场风波，这是我的责任
但是我一个人的力量有限
所以我希望你能够协助我，我对你的能力有信心
借给我你的力量去阻止火岩队（水舰队）疯狂的野心吧！
如果我们的PM齐心协力，我们一定能克服这个惨重的时刻
我不认为这是不可能的
我将用这个委托你
大吾赠送给了玩家
从绿岭市向下出海，进入127号水道，在看见的第一块深水区域潜水就可以找到海底洞窟（注意水下也有训练师可以触发对战）
从海底洞窟浮上看到了火岩队（水舰队）的潜水艇
进入海底洞窟准备最终决战！
*注意完成此剧情必要的秘传机为 冲浪、潜水、碎岩、怪力
海底洞窟的机关部分和原来类似，不论是从下方的洞口还是上方的洞口都能到下一个洞（下方稍微绕远一些）
接着到达有急流的洞（无论左边还是右边都会到达，但是急流不相同）
从左边的洞进去，如果到达了左边的平地，不要进那个洞因为那是回到入口的洞
想要进右边的洞稍微麻烦一些，需要怪力推石头，右边的洞里急流中心可以获得
通过两边有急流的洞后会再次到达相同的洞穴
接着进入下个洞穴，又是一次怪力推石头的考验
（以下教程左右可互换）
先将两边可以推下的石头推下，接着将左边的第二块石头推向最左以让出通道
接着将右边的第二块石头往中间推，推到右边第三块石头可以被向下推为止
接着从左边让出的通道向上走，将右边第三块石头向下推后，就可以将右边第四块石头推入坑内通过啦！
进入下一个洞穴，没有小兵可以径直走，在最后一个洞口前可以拿到
进入最后一个洞口，发现水梧桐（赤焰松）刚被赤焰松（水梧桐）打败
上前，赤焰松（水梧桐）得意的说了一番话，说自己终于得到了原始固拉多（原始盖欧卡）的力量，说主角是他剩下的唯一一个阻碍，触发战斗
| 火岩队首领 赤焰松 | |
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大狼犬 lv41 |
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双弹瓦斯 lv41 |
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叉字蝠 lv41 |
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Mega喷火驼 lv43 |
| 水舰队首领 水梧桐 | |
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大狼犬 lv41 |
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臭臭泥 lv41 |
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叉字蝠 lv41 |
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Mega巨牙鲨 lv43 |
战胜后赤焰松（水梧桐）称主角为英雄，但他的梦不会动摇，他将用红色宝珠（蓝色宝珠）复活固拉多（盖欧卡）并将其变为原始形态结束这一切
这时候火村（泉美）冲了出来阻止赤焰松（水梧桐）（这和说好的不一样啊喂）
他说古拉顿（盖欧卡）苏醒的话会让世界毁灭
但是赤焰松（水梧桐）不听劝告，复活了固拉多（盖欧卡）（可开3D看动画）
固拉多（盖欧卡）从海底洞窟钻出，并朝向琉璃市前进
这时候赤焰松（水梧桐）收到消息说 固拉多带来的热远远超出预计（盖欧卡带来的降雨远远超出预计），甚至会危害到他们自身
赤焰松（水梧桐）不相信，说明明刚醒来怎么会有这么强大的力量
水梧桐（赤焰松）说 他和赤焰松（水梧桐）可能都低估了超古代PM的力量，原始固拉多带来的是“终结”（原始盖欧卡带来的是“起源”），会让星球上所有生物死亡，我们迎来的只有毁灭人类的绝望
火村（泉美）说天气研究所说的是对的，然后将所有人带出海底洞窟
世界变成一片阳光猛烈的黄色（世界被乌云的黑暗笼罩），赤焰松（水梧桐）说这不是他想要的
水梧桐（赤焰松）说他们将去琉璃市，固拉多（盖欧卡）会在觉醒寺的深处等着，因为那里是为原始进化必需的能量池，所以固拉多（盖欧卡）一定会因为想要能量而前往那里
他们离开后大吾来了，说如果不阻止的话全世界都会被晒干（淹没），然后也去了琉璃市
从另外的深海前往琉璃市吧（固拉多的天气下所有水系攻击技能全部无效，盖欧卡的天气下所有火系攻击技能全部无效）
经过一小段深水区就能看到新城市——琉璃市（ルネシティ Sootopolis City）的入口
到了之后就朝着觉醒寺的方向去吧
路上看到大吾和米可利
米可利说干旱（暴雨）是由觉醒寺深处的能量导致的，然后发现主角带着 蓝色宝珠（红色宝珠），便让主角跟着他走
到达觉醒寺门口，看到赤焰松、火村（泉美）和水梧桐
赤焰松将火岩队（水舰队）套装（Magma Suit）送给了主角，这个和蓝色宝珠（红色宝珠）配合能够抑制固拉多（盖欧卡）的能量从而保护主角不受伤害
这时候CP出现了给主角以鼓励
那么进入觉醒寺吧
不需要任何秘传机就能到达最深处
到达最深处后，主角换上了套装，以及用蓝色宝珠（红色宝珠）保护了自己，这时候固拉多（盖欧卡）出现了
这时候套装里出现了声音，是赤焰松（水梧桐）的通讯，但是话说到一半就断了
主角骑上了固拉多（盖欧卡）（这是什么剧本）向更深处移动
到了觉醒寺最深处，主角脱下了套装，这里领航员完全失效，保存后上前和固拉多（盖欧卡）对话，固拉多（盖欧卡）原始进化后触发战斗
（打倒后二周目可以从觉醒寺1F左边的洞口直达深处重新捕获）
收服或打倒后，觉醒寺深处崩塌，天气恢复原样了，世界恢复成原来的样子了（BGM好听）
各地的人们都出来仰望重新湛蓝的天空
*细节：篝火和身旁的“火岩队队员”（新人物Zinnia）
离开觉醒寺后，大家都说了些煽情的话（就不转述了）
赤焰松说主角至少能在一次对战的短时间内控制原始进化，将红色宝珠交给了主角后离开了，大吾将无限之笛赠给了主角后也离开了，CP说了些煽情的话后也离开了
从觉醒寺出来往右边走可以获得勾魂眼Mega石
那么去挑战道馆吧！
琉璃道馆的机关和原来差不多，还是走冰块，但是难度有所提升（注意可以走斜线）（画图太麻烦以后有空画你们还是自己探索吧！
走过冰块后就到米可利的面前了
米可利 ミクリ Wallace
爱心鱼 lv44
特性：轻快
技能：水之波动+魅惑+天使之吻+吸收之吻
鲶鱼王 lv44
特性：顿感
技能：玩泥+登瀑+思念头槌+地震
海魔狮 lv44
特性：厚脂肪
技能：鼓掌+压制+极光束+登瀑
金鱼王 lv44
特性：轻快
技能：液体圈+祈雨+登瀑+独角钻
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